无论是单一花蜜还是混合蜜，都有一定的色泽，蜂蜜的色泽与蜜蜂采集的蜜源植物种类有直接关系。由不同蜜源植物的花蜜酿制成的蜂蜜，其色泽有着明显的差异，这种差异在很大程度上也反映了蜂蜜质量的好坏。一般认为，浅色蜜在质量上优于深色蜜，浅色蜂蜜味香清淡，深色蜂蜜味重浓烈。
按照颜色对蜂蜜分类有两种方法：一种是依据感官鉴定蜂蜜的颜色并进行分类，分为白蜜、黄蜜、红蜜；另一种是依据仪器来鉴定蜂蜜的颜色，并进行分类。国际市场上的蜂蜜分为特种花蜜（单一花蜜）和色蜜（混合蜜）。按蜂蜜实际存在的色泽差异，我国将其分为七类：水白色、特白色、白色、特浅琥珀色、浅琥珀色、琥珀色、琥珀色、深琥珀色。